Komnaty, znacznie wyższe i obszerniejsze w stosunku do sal niższych kondygnacji, służyły celom reprezentacyjnym. Tutaj odbywały się posiedzenia sejmu i senatu, królewskie audiencje i uroczystości weselne oraz bale. Wśród nich: sala Poselska – jedna z dwóch największych komnat pałacu, zwana także Pod Głowami oraz sala Senatorska – największa, reprezentacyjna sala zamku, w której odbywały się posiedzenia senatu, inauguracje obrad sejmu i ważne ceremonie państwowe.

Najcenniejszym elementem ekspozycji renesansowych komnat, jedynym zachowanym z ich pierwotnego wystroju, są arrasy, utkane w Brukseli na zamówienie Zygmunta Augusta w 3. ćwierci w. XVI, o tematyce biblijnej, bądź z ornamentem groteskowym oraz z herbami Polski i Litwy. Są tu również dużej wartości artystycznej obrazy i meble włoskie, głównie toskańskie, z w. XVI oraz portrety polskich monarchów.

Kolekcja namiotów tureckich Zamku Królewskiego na Wawelu to autentycznie największy tego rodzaju zbiór w europejskich muzeach. Bogato dekorowane aplikacjami o motywach roślinnych, nasycone kolorami, zwane ruchomymi pałacami Orientu, w armii tureckiej namioty pełniły różne funkcje, które korespondowały z kształtem architektury i jej dekoracją. 

Ekspozycji namiotów tureckich towarzyszą najwyższej klasy przedmioty rzemiosła artystycznego oraz militaria (z obszarów od Morza Śródziemnego po północne Indie).